Programma

Praktisch

• Datum: maandag 03/10/2022
• Lesgevers: Jasper Decuyper en Paco Hulpiau

Thema’s

• DNA en RNA, eigenschappen, sequentiestatistiek, similariteit
• Complete genoomsequenties
• Referentiesequenties
• DNA en proteïne databanken
• Medische databanken
• Bestandsformaten (fasta, genbank, …)
• Oefeningen

Praktisch

• Datum: maandag 07/11/2022
• Lesgevers: Jasper Decuyper en Paco Hulpiau

Thema’s

• Aligneren 
• Multiple sequence alignment en fylogenie
• BLAST
• Primer en probe design 
• Oefeningen 

Praktisch

• Datum: maandag 05/12/2022
• Lesgevers: Kim De Leeneer en Toon Rosseel

Thema’s

• Sequentievarianten, HGNC en HGVS nomenclatuur
• Coderende varianten
• Niet-coderende varianten (splice site, promotor …)
• Variant en tumor databanken (dbSNP, 1000G, COSMIC …)
• Annotatie van sequentievarianten
• Kennismaking met Galaxy (webgebaseerd platform voor bio-informatica analyse)
• Oefeningen 

Praktisch

• Datum: maandag 23/01/2023
• Lesgevers: Paco Hulpiau en Cedric Hermans

Thema’s

• Demonstratie van tools gebruikt door bio-informatici
  • Eerste stappen in Linux, favoriete besturingssysteem in bio-informatica
  • Ontdekken van R, een statistische programmeeromgeving 
  • Kennismaking met scripting
• Oefeningen

Praktisch

• Datum: maandag 06/03/2023
• Lesgevers: Friedel Nollet en Tom Sante

Thema’s

• NGS DNA sequencing
• Primaire en secundaire data-analyse op Illumina platformen
• Primaire en secundaire data-analyse op Ion Torrent platformen
• Pijplijnen
• Kwaliteitscontrole van data
• Bio-informatica en ISO15189
• Oefeningen 

Praktisch

• Datum: maandag 23/04/2023
• Lesgever: Tom Sante

Thema’s

• IT-infrastructuur van de bio-informaticus
  • Dataopslag (Cloud, server)
  • Datatransfer en integriteit
  • Veiligheid en privacy van dataopslag
• Bio-informatica tools
• FAIR data, data protectie en GDPR
• Oefeningen 

Praktisch

• Datum: zaterdag 13/05/2023
• Sprekers: diverse

Thema’s

Tijdens het MLT-symposium dat doorgaat op zaterdag 13 mei 2023 zal een parallelle sessie ‘Bio-informatica’ worden voorzien waarin verschillende sprekers hun expertise delen omtrent recente en toekomstige ontwikkelingen op het vlak van bio-informatica in diverse domeinen. Deelnemers aan de navormingscyclus zullen als afsluiter van deze cyclus kosteloos kunnen deelnemen aan het MLT symposium.