Programma

Sessie 1: Het referentiegenoom

howest illustraties_programma cropped.png

Praktisch

  • Datum: maandag 03/10/2022
  • Lesgevers: Jasper Decuyper en Paco Hulpiau

Thema’s

  • DNA en RNA, eigenschappen, sequentiestatistiek, similariteit
  • Complete genoomsequenties
  • Referentiesequenties
  • DNA en proteïne databanken
  • Medische databanken
  • Bestandsformaten (fasta, genbank, …)
  • Oefeningen

Sessie 2: Werken met sequenties

howest illustraties_programma cropped.png

Praktisch

  • Datum: maandag 07/11/2022
  • Lesgevers: Jasper Decuyper en Paco Hulpiau

Thema’s

  • Aligneren 
  • Multiple sequence alignment en fylogenie
  • BLAST
  • Primer en probe design 
  • Oefeningen 

Sessie 3: Opsporen van mutaties, varianten en polymorfismen

howest illustraties_programma cropped.png

Praktisch

  • Datum: maandag 05/12/2022
  • Lesgevers: Kim De Leeneer en Toon Rosseel

Thema’s

  • Sequentievarianten, HGNC en HGVS nomenclatuur
  • Coderende varianten
  • Niet-coderende varianten (splice site, promotor …)
  • Variant en tumor databanken (dbSNP, 1000G, COSMIC …)
  • Annotatie van sequentievarianten
  • Kennismaking met Galaxy (webgebaseerd platform voor bio-informatica analyse)
  • Oefeningen 

Sessie 4: Automatisatie en scripting

howest illustraties_programma cropped.png

Praktisch

  • Datum: maandag 23/01/2023
  • Lesgevers: Paco Hulpiau en Cedric Hermans

Thema’s

  • Demonstratie van tools gebruikt door bio-informatici
    • Eerste stappen in Linux, favoriete besturingssysteem in bio-informatica
    • Ontdekken van R, een statistische programmeeromgeving 
    • Kennismaking met scripting
  • Oefeningen

Sessie 5: Analyse pijplijnen en kwaliteitscontrole

howest illustraties_programma cropped.png

Praktisch

  • Datum: maandag 06/03/2023
  • Lesgevers: Friedel Nollet en Tom Sante

Thema’s

  • NGS DNA sequencing
  • Primaire en secundaire data-analyse op Illumina platformen
  • Primaire en secundaire data-analyse op Ion Torrent platformen
  • Pijplijnen
  • Kwaliteitscontrole van data
  • Bio-informatica en ISO15189
  • Oefeningen 

Sessie 6: Infrastructuur en dataveiligheid & bio-informatica softwarepakketten

howest illustraties_programma cropped.png

Praktisch

  • Datum: maandag 23/04/2023
  • Lesgever: Tom Sante

Thema’s

  • IT-infrastructuur van de bio-informaticus
    • Dataopslag (Cloud, server)
    • Datatransfer en integriteit
    • Veiligheid en privacy van dataopslag
  • Bio-informatica tools
  • FAIR data, data protectie en GDPR
  • Oefeningen 

Sessie 7: Nieuwste toepassingen in specifieke domeinen

howest illustraties_programma cropped.png

Praktisch

  • Datum: zaterdag 13/05/2023
  • Sprekers: diverse

Thema’s

Tijdens het MLT-symposium dat doorgaat op zaterdag 13 mei 2023 zal een parallelle sessie ‘Bio-informatica’ worden voorzien waarin verschillende sprekers hun expertise delen omtrent recente en toekomstige ontwikkelingen op het vlak van bio-informatica in diverse domeinen. Deelnemers aan de navormingscyclus zullen als afsluiter van deze cyclus kosteloos kunnen deelnemen aan het MLT symposium.