Programma
Sessie 1: Het referentiegenoom

Praktisch
- Datum: maandag 03/10/2022
- Lesgevers: Jasper Decuyper en Paco Hulpiau
Thema’s
- DNA en RNA, eigenschappen, sequentiestatistiek, similariteit
- Complete genoomsequenties
- Referentiesequenties
- DNA en proteïne databanken
- Medische databanken
- Bestandsformaten (fasta, genbank, …)
- Oefeningen
Sessie 3: Opsporen van mutaties, varianten en polymorfismen

Praktisch
- Datum: maandag 05/12/2022
- Lesgevers: Kim De Leeneer en Toon Rosseel
Thema’s
- Sequentievarianten, HGNC en HGVS nomenclatuur
- Coderende varianten
- Niet-coderende varianten (splice site, promotor …)
- Variant en tumor databanken (dbSNP, 1000G, COSMIC …)
- Annotatie van sequentievarianten
- Kennismaking met Galaxy (webgebaseerd platform voor bio-informatica analyse)
- OefeningenÂ
Sessie 4: Automatisatie en scripting

Praktisch
- Datum: maandag 23/01/2023
- Lesgevers: Paco Hulpiau en Cedric Hermans
Thema’s
- Demonstratie van tools gebruikt door bio-informatici
- Eerste stappen in Linux, favoriete besturingssysteem in bio-informatica
- Ontdekken van R, een statistische programmeeromgevingÂ
- Kennismaking met scripting
- Oefeningen
Sessie 5: Analyse pijplijnen en kwaliteitscontrole

Praktisch
- Datum: maandag 06/03/2023
- Lesgevers: Friedel Nollet en Tom Sante
Thema’s
- NGS DNA sequencing
- Primaire en secundaire data-analyse op Illumina platformen
- Primaire en secundaire data-analyse op Ion Torrent platformen
- Pijplijnen
- Kwaliteitscontrole van data
- Bio-informatica en ISO15189
- OefeningenÂ
Sessie 6: Infrastructuur en dataveiligheid & bio-informatica softwarepakketten

Praktisch
- Datum: maandag 23/04/2023
- Lesgever: Tom Sante
Thema’s
- IT-infrastructuur van de bio-informaticus
- Dataopslag (Cloud, server)
- Datatransfer en integriteit
- Veiligheid en privacy van dataopslag
- Bio-informatica tools
- FAIR data, data protectie en GDPR
- OefeningenÂ
Sessie 7: Nieuwste toepassingen in specifieke domeinen

Praktisch
- Datum: zaterdag 13/05/2023
- Sprekers: diverse
Thema’s
Tijdens het MLT-symposium dat doorgaat op zaterdag 13 mei 2023 zal een parallelle sessie ‘Bio-informatica’ worden voorzien waarin verschillende sprekers hun expertise delen omtrent recente en toekomstige ontwikkelingen op het vlak van bio-informatica in diverse domeinen. Deelnemers aan de navormingscyclus zullen als afsluiter van deze cyclus kosteloos kunnen deelnemen aan het MLT symposium.Â